功能性紊乱可以通过服用药物或者调节生活饮食习惯进行治疗，功能性紊乱应该根据内脏功能的正常与否进行细节性区分，如胃肠道功能紊乱可通过具体症状服用药物，如奥美拉唑等护胃药，可缓解胃酸分泌，维护胃肠道黏膜，保障胃肠道功能。脑部功能性紊乱可通过服用调节神经性药物，缓解脑部垂体发送的各种神经因子对外周系统的敏感性，从而起到缓解功能紊乱的效果。性功能紊乱可通过服用激素类药物，如雌激素、雄激素，缓解月经过多、过少或继发性精神功能紊乱，如脾气暴躁、记忆力下降等症状，调节饮食生活习惯要顺应个人机体功能。