肠胃不舒服引起的发烧，其治疗需要看肠胃不舒服本身的疾病以及发烧的程度，引起肠胃不舒服常见的疾病有急性胃肠炎、胃肠型感冒、功能性消化不良。如果是前两种情况引起的发烧，程度没有超过38.5℃时，可以多喝水加抗感染或抗病毒治疗即可缓解。如果是功能性的消化不良引起的发烧，体温不高时在控制进食后用促进消化和吸收的药物，多半也会自己缓解。如果发烧的程度超过38.5℃，急性胃肠炎或胃肠型感冒需要使用肌注复方双氯芬酸钠或柴胡注射液来治疗。功能性消化不良引起的高烧，在临床上并不多见。如果有，也可以口服退烧药物来治疗，常见的有扑热息痛。