多囊肾目前尚无特殊疗法主要为对症处理，以缓解症状预防和处理并发症。针对囊肿本身尚无明确的治疗方法，近年来随着对多囊肾发病机制的研究，为该病的治疗提供了很多新的靶点。首先一般处理尽量避免剧烈运动，避免使用咖啡因茶碱等物质，对于腰腹痛的患者包括卧床休息，镇痛剂，甚至手术处理，如囊肿穿刺引流减压术以及肾脏切除术等，尿路感染肾结石梗阻需要积极处理。第二、降压治疗，必须严格控制血压，首选药物为ACER和ARB类。第三、改善多囊肾患者的肾小球滤过率及肾皮质血流量，选用他汀类药物。第四、延缓肾囊肿发展，稳定肾功能，药物有血管加压素VR受体拮抗剂，生长抑素类似物，西罗莫司、PPR伽马受体激动剂等。