肠结核首先要明确诊断，在早期诊断后，采取及时的抗结核药物治疗。抗结核的药物治疗，应当足量，规范，并且联合用药，至少要应用18个月以上。前6个月，可以选择四联药物治疗，为强化的治疗阶段。后面的12~15个月，可以选择两联药物进行治疗，可以有效的进行巩固。在服用抗结核药物治疗的同时，要配合营养支持，以及保肝药物的应用。应当定期检测肝肾功能和肠镜检查，如果有并发症，应当及时进行手术治疗。