咳嗽腰疼的治疗，应该针对咳嗽进行全面的评估，在临床当中根据咳嗽的时间长短分为急性咳嗽、亚急性咳嗽、慢性咳嗽，具体的咳嗽病因进行全面的评估和明确诊断，如果为急性咳嗽大多考虑和感染相关，应该给予相应的抗感染治疗。另外，如果患者出现明显的腰痛，建议完善相关的检查，包括腹部的B超以及CT检查等以明确诊断，同时针对于腰部的CT，包括椎间盘的检查以及相应的检查应该完善，评估是否合并有腰部的病变。咳嗽如果出现较为剧烈，有可能会累及到肌肉的情况出现疼痛，应该进行综合的系统评估。