新生儿消化不良可以通过以下方法进行治疗：1.对症治疗新生儿消化不良可由喂养方式不对、配方选择不合理、喂食过多以及生活环境等因素导致。想要治疗消化不良的症状，首先就要找到具体的病因，然后进行针对性治疗。比如调整喂养方式、食量、选择合适配方以及调整生活环境等。2.药物治疗对于哭闹不止、症状严重的新生儿，需要进行相关检查明确是否存在病理因素，如合并胃食管反流，存在乳糖不耐受或牛奶蛋白过敏等。多数情况不需要用药，如果使用药物，需要咨询专业医生。3.其他治疗如果新生儿经常出现消化不良的症状，可以补充一些肠道益生菌，以改善胃肠道功能。