早起腰疼的原因有很多，有可能是因为白天过于劳累、腰部负重过大，或者夜间睡觉姿势不当引起，造成腰部肌肉扭伤、韧带拉伤等，这种情况患者不必紧张，注意休息，并减少活动即可。如果长期早起腰疼不能缓解，或者进行性加重，有可能是腰椎病，如腰椎间盘突出、类风湿脊柱炎、脊髓炎、神经根炎等等。如果是单侧腰疼，也有可能是肾脏疾病，比如泌尿系统结石、感染等。如果是女性有可能是妇科方面的疾病导致，比如盆腔炎、子宫内膜炎等。总之，如果腰疼持续时间比较长或者疼痛比较剧烈，还是建议及时就医，经过完善的检查之后确认病因，具体情况具体治疗。