在青春期，男性的阴茎在睾丸分泌的雄性激素刺激下开始发育，约到16岁左右发育完成。大小一般是疲软状态不低于三厘米，勃起之后不低于八厘米。如果不符合这个标准，称之为阴茎短小。常见的原因有严重的包茎，或者是睾丸功能异常，以及先天性的染色体异常和合并有一些其他的阴茎畸形。例如阴茎上下弯，侧弯，璞状阴茎。还有一种是相对不太异常的情况，就是隐匿性阴茎。它是由于局部脂肪的过度堆积，导致阴茎体深埋在体内，无法显露出来，但是其长度是正常的。