通过热水解预处理工艺、酸性预处理工艺、碱性预处理工艺和微波预处理工艺这4种预处理工艺均可以达到富集产氢菌的目的，这说明只要采取一定的措施抑制耗氢菌的生长，就可以收集到氢气。但是，通过预处理工艺富集产氢菌方法的操作过程相对繁琐，而且需要消耗一定的能量。如果采用加入添加剂的方式富集产氢菌，可以获得加入药剂即时生效的效果，则会使整个富集产氢菌的过程变得相对简单。

很多化学药品如酚、合成洗涤剂（阴离子型）、新洁尔灭、染料等具有杀毒灭菌的效果，也具有抑制耗氢菌生长、富集产氢菌的效果。在堆肥和厌氧消化中，阴离子表面活性剂因其独特的作用而获得越来越多的应用，一方面阴离子表面活性剂具有灭菌的作用，另一方面在环境中阴离子表面活性剂容易被微生物降解，不会给环境造成额外的负担。阴离子表面活性剂十二烷基苯磺酸钠与酶的混合物可以有效抑制耗氢菌的生长，提高水解酶的活性，从而提高氢气的产率和产量。