含有砂石或其他无机物质的污泥消化时，通常消化池中会发生这些物质的积累。有些消化池，例如卵形消化池和具有强烈搅拌的消化池，可使积累量最小。但是，在多数情况下设计者应考虑为砂石清洗提供方便。

合理的设计应设置便于进入圆形消化池进行清洗的入口；池内构件尽可能采用可拆结构；消化池周围有供排水和排泥的出口；附设一个高压（大约700kN/m2），高流量（大约60L/s）供水（供冲洗用）系统。

通常，在清洗消化池时，首先应尽可能多地排出消化污泥，然后把重的沉积物从消化池内排出（通常用人工）。有的工厂用贮存塘放置重的消化污泥，使液体和固体在塘中获得分离，液体通常返回到污水处理设备，而固体脱水后处置。通常为这一目的而设计的贮存塘的体积为消化池最大体积的20%～40%。

另一种清洗消化池的方法是把重物料泵入一个机械脱砂装置，砂石收集在另一个容器中进行处置，分出的污泥和液体返回到消化池。这种方法减少了臭气，但要有专用的机械设备。