较早的多膛炉存在怎样设计各个区域的困惑，即干燥、燃烧及燃尽/冷却区域的分配问题。如果在较上部区域燃烧，以保证污泥的干燥，那么污泥中挥发分难以完全析出，而且燃烧温度也不能保证使污泥焚烧。如果燃烧主要在多膛炉下部进行，以保证污泥的燃尽率，那么会使得灰分不能得到足够的冷却，对灰处理设备形成损害。目前，其最优解决方法为将干燥区的水蒸气再循环引向燃烧区域，并以较高的温度离开炉膛。

多膛式焚烧炉优点主要在于具有一个高效的内部热量利用系统，焚烧后的烟气能很好地同污泥进行接触加热，燃烧效率高，加之其对各种不同含水率的污泥的适应性强、燃烧温度易于控制等优点而一度得到了广泛的应用。但在长期的使用过程中，多膛炉的缺点也较为突出，主要有：a.在污泥处理时需要不断地添加辅助燃料，故辅助燃料消耗较多，成本增加；b.机械设备较多，故维修与保养较复杂；c.搅拌杆、搅拌齿、炉床、耐火材料均易受损伤；d.通常需设二次燃烧设备，以消除恶臭污染；e. 二次污染严重；f.由于污泥自身热值的提高使炉温上升会产生搅拌臂消耗，进一步增加成本等。由于以上诸多原因，多膛炉越来越失去竞争力，促使流化床焚烧炉成为较受欢迎的污泥焚烧装置。